Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxn3Q499D0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Foxn3Q499D0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxn3Q499D0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms