Protein–RNA interactions for Protein: Q3V209

Tmub2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub2Q3V209 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmub2Q3V209 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms