Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ulk4Q3V129 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ulk4Q3V129 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms