Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms