Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0B4

Cfap65, Cilia- and flagella-associated protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 1,847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap65Q3V0B4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cfap65Q3V0B4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cfap65Q3V0B4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cfap65Q3V0B4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cfap65Q3V0B4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cfap65Q3V0B4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cfap65Q3V0B4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cfap65Q3V0B4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cfap65Q3V0B4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cfap65Q3V0B4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cfap65Q3V0B4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cfap65Q3V0B4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cfap65Q3V0B4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cfap65Q3V0B4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cfap65Q3V0B4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Cfap65Q3V0B4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cfap65Q3V0B4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cfap65Q3V0B4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cfap65Q3V0B4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cfap65Q3V0B4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cfap65Q3V0B4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cfap65Q3V0B4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cfap65Q3V0B4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cfap65Q3V0B4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Cfap65Q3V0B4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cfap65Q3V0B4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cfap65Q3V0B4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cfap65Q3V0B4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cfap65Q3V0B4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cfap65Q3V0B4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cfap65Q3V0B4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cfap65Q3V0B4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cfap65Q3V0B4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cfap65Q3V0B4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cfap65Q3V0B4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cfap65Q3V0B4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cfap65Q3V0B4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Cfap65Q3V0B4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cfap65Q3V0B4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cfap65Q3V0B4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Cfap65Q3V0B4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cfap65Q3V0B4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cfap65Q3V0B4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Cfap65Q3V0B4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cfap65Q3V0B4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms