Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc27Q3V036 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc27Q3V036 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc27Q3V036 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms