Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbsponQ3UPR9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbsponQ3UPR9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbsponQ3UPR9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbsponQ3UPR9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbsponQ3UPR9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbsponQ3UPR9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SbsponQ3UPR9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbsponQ3UPR9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbsponQ3UPR9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbsponQ3UPR9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbsponQ3UPR9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbsponQ3UPR9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbsponQ3UPR9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbsponQ3UPR9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbsponQ3UPR9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbsponQ3UPR9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbsponQ3UPR9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbsponQ3UPR9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SbsponQ3UPR9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbsponQ3UPR9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbsponQ3UPR9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbsponQ3UPR9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbsponQ3UPR9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbsponQ3UPR9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms