Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nhlrc4Q3UP44 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nhlrc4Q3UP44 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms