Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNW5

Tfcp2l1, Transcription factor CP2-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tfcp2l1Q3UNW5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tfcp2l1Q3UNW5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tfcp2l1Q3UNW5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tfcp2l1Q3UNW5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tfcp2l1Q3UNW5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tfcp2l1Q3UNW5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tfcp2l1Q3UNW5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tfcp2l1Q3UNW5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tfcp2l1Q3UNW5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tfcp2l1Q3UNW5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tfcp2l1Q3UNW5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tfcp2l1Q3UNW5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tfcp2l1Q3UNW5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tfcp2l1Q3UNW5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tfcp2l1Q3UNW5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tfcp2l1Q3UNW5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tfcp2l1Q3UNW5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tfcp2l1Q3UNW5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tfcp2l1Q3UNW5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tfcp2l1Q3UNW5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tfcp2l1Q3UNW5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tfcp2l1Q3UNW5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tfcp2l1Q3UNW5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tfcp2l1Q3UNW5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tfcp2l1Q3UNW5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tfcp2l1Q3UNW5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tfcp2l1Q3UNW5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tfcp2l1Q3UNW5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tfcp2l1Q3UNW5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tfcp2l1Q3UNW5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tfcp2l1Q3UNW5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tfcp2l1Q3UNW5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tfcp2l1Q3UNW5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tfcp2l1Q3UNW5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms