Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc61Q3UJV1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms