Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp19Q3UJD6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp19Q3UJD6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms