Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf224Q3UIW8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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