Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW5

Rnf10, RING finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf10Q3UIW5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf10Q3UIW5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf10Q3UIW5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf10Q3UIW5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf10Q3UIW5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf10Q3UIW5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf10Q3UIW5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf10Q3UIW5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf10Q3UIW5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf10Q3UIW5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf10Q3UIW5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf10Q3UIW5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf10Q3UIW5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf10Q3UIW5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf10Q3UIW5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf10Q3UIW5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf10Q3UIW5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf10Q3UIW5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf10Q3UIW5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf10Q3UIW5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf10Q3UIW5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf10Q3UIW5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf10Q3UIW5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf10Q3UIW5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf10Q3UIW5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf10Q3UIW5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf10Q3UIW5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf10Q3UIW5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Rnf10Q3UIW5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf10Q3UIW5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms