Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc34Q3UI66 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc34Q3UI66 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.7 ms