Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI4

Tmed8, Protein TMED8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed8Q3UHI4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmed8Q3UHI4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms