Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Zswim8Q3UHH1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zswim8Q3UHH1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zswim8Q3UHH1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zswim8Q3UHH1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zswim8Q3UHH1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zswim8Q3UHH1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zswim8Q3UHH1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zswim8Q3UHH1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Zswim8Q3UHH1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zswim8Q3UHH1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zswim8Q3UHH1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zswim8Q3UHH1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zswim8Q3UHH1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Zswim8Q3UHH1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zswim8Q3UHH1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms