Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnrc6cQ3UHC0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms