Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Arfgef3Q3UGY8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arfgef3Q3UGY8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms