Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Nom1Q3UFM5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nom1Q3UFM5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nom1Q3UFM5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nom1Q3UFM5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nom1Q3UFM5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Nom1Q3UFM5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Nom1Q3UFM5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nom1Q3UFM5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nom1Q3UFM5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nom1Q3UFM5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nom1Q3UFM5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nom1Q3UFM5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nom1Q3UFM5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nom1Q3UFM5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nom1Q3UFM5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nom1Q3UFM5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nom1Q3UFM5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nom1Q3UFM5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nom1Q3UFM5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nom1Q3UFM5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nom1Q3UFM5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nom1Q3UFM5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nom1Q3UFM5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nom1Q3UFM5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nom1Q3UFM5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nom1Q3UFM5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Nom1Q3UFM5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nom1Q3UFM5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms