Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEZ8

Slc10a4, Sodium/bile acid cotransporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc10a4Q3UEZ8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc10a4Q3UEZ8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc10a4Q3UEZ8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc10a4Q3UEZ8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc10a4Q3UEZ8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc10a4Q3UEZ8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc10a4Q3UEZ8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc10a4Q3UEZ8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc10a4Q3UEZ8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc10a4Q3UEZ8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc10a4Q3UEZ8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc10a4Q3UEZ8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc10a4Q3UEZ8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc10a4Q3UEZ8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc10a4Q3UEZ8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc10a4Q3UEZ8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc10a4Q3UEZ8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc10a4Q3UEZ8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc10a4Q3UEZ8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc10a4Q3UEZ8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc10a4Q3UEZ8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc10a4Q3UEZ8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc10a4Q3UEZ8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc10a4Q3UEZ8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc10a4Q3UEZ8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc10a4Q3UEZ8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc10a4Q3UEZ8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc10a4Q3UEZ8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc10a4Q3UEZ8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc10a4Q3UEZ8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc10a4Q3UEZ8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc10a4Q3UEZ8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc10a4Q3UEZ8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc10a4Q3UEZ8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc10a4Q3UEZ8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc10a4Q3UEZ8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc10a4Q3UEZ8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc10a4Q3UEZ8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc10a4Q3UEZ8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc10a4Q3UEZ8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc10a4Q3UEZ8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc10a4Q3UEZ8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc10a4Q3UEZ8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc10a4Q3UEZ8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc10a4Q3UEZ8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc10a4Q3UEZ8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms