Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Parp8Q3UD82 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Parp8Q3UD82 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Parp8Q3UD82 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Parp8Q3UD82 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Parp8Q3UD82 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Parp8Q3UD82 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Parp8Q3UD82 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Parp8Q3UD82 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Parp8Q3UD82 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Parp8Q3UD82 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Parp8Q3UD82 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Parp8Q3UD82 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Parp8Q3UD82 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Parp8Q3UD82 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Parp8Q3UD82 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms