Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssbp4Q3U4B1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssbp4Q3U4B1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms