Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gse1Q3U3C9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gse1Q3U3C9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms