Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Otud5Q3U2S4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Otud5Q3U2S4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms