Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXS7

Psmd1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd1Q3TXS7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Psmd1Q3TXS7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmd1Q3TXS7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms