Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccndbp1Q3TVC7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccndbp1Q3TVC7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms