Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM4

Pnpla6, Neuropathy target esterase, mousemouse

Predictions only

Length 1,355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla6Q3TRM4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pnpla6Q3TRM4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pnpla6Q3TRM4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pnpla6Q3TRM4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms