Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc13Q3TIR1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc13Q3TIR1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms