Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Shroom4Q1W617 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Shroom4Q1W617 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Shroom4Q1W617 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Shroom4Q1W617 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Shroom4Q1W617 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Shroom4Q1W617 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Shroom4Q1W617 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Shroom4Q1W617 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Shroom4Q1W617 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Shroom4Q1W617 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Shroom4Q1W617 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Shroom4Q1W617 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Shroom4Q1W617 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Shroom4Q1W617 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Shroom4Q1W617 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Shroom4Q1W617 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Shroom4Q1W617 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Shroom4Q1W617 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Shroom4Q1W617 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Shroom4Q1W617 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Shroom4Q1W617 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Shroom4Q1W617 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Shroom4Q1W617 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Shroom4Q1W617 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Shroom4Q1W617 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Shroom4Q1W617 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Shroom4Q1W617 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Shroom4Q1W617 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Shroom4Q1W617 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Shroom4Q1W617 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Shroom4Q1W617 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Shroom4Q1W617 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Shroom4Q1W617 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Shroom4Q1W617 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Shroom4Q1W617 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Shroom4Q1W617 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Shroom4Q1W617 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Shroom4Q1W617 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Shroom4Q1W617 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Shroom4Q1W617 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Shroom4Q1W617 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Shroom4Q1W617 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC31.14■■■□□ 2.57
Shroom4Q1W617 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.57
Shroom4Q1W617 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Shroom4Q1W617 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Shroom4Q1W617 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Shroom4Q1W617 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Shroom4Q1W617 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Shroom4Q1W617 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Shroom4Q1W617 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Shroom4Q1W617 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Shroom4Q1W617 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Shroom4Q1W617 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Shroom4Q1W617 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Shroom4Q1W617 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Shroom4Q1W617 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Shroom4Q1W617 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Shroom4Q1W617 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Shroom4Q1W617 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Shroom4Q1W617 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Shroom4Q1W617 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
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Shroom4Q1W617 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Shroom4Q1W617 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Shroom4Q1W617 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Shroom4Q1W617 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Shroom4Q1W617 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Shroom4Q1W617 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
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Shroom4Q1W617 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Shroom4Q1W617 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Shroom4Q1W617 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Shroom4Q1W617 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Shroom4Q1W617 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Shroom4Q1W617 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Shroom4Q1W617 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Shroom4Q1W617 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Shroom4Q1W617 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Shroom4Q1W617 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Shroom4Q1W617 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Shroom4Q1W617 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Shroom4Q1W617 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Shroom4Q1W617 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Shroom4Q1W617 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Shroom4Q1W617 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Shroom4Q1W617 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Shroom4Q1W617 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Shroom4Q1W617 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Shroom4Q1W617 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Shroom4Q1W617 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Shroom4Q1W617 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Shroom4Q1W617 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Shroom4Q1W617 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Shroom4Q1W617 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Shroom4Q1W617 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Shroom4Q1W617 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Shroom4Q1W617 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Shroom4Q1W617 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Shroom4Q1W617 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms