Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
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Tdrd9Q14BI7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tdrd9Q14BI7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tdrd9Q14BI7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
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Tdrd9Q14BI7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
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Tdrd9Q14BI7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
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Tdrd9Q14BI7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
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Tdrd9Q14BI7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Tdrd9Q14BI7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tdrd9Q14BI7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tdrd9Q14BI7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tdrd9Q14BI7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tdrd9Q14BI7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tdrd9Q14BI7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tdrd9Q14BI7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tdrd9Q14BI7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tdrd9Q14BI7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Tdrd9Q14BI7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tdrd9Q14BI7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tdrd9Q14BI7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tdrd9Q14BI7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tdrd9Q14BI7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tdrd9Q14BI7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tdrd9Q14BI7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms