Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rpusd3Q14AI6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpusd3Q14AI6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms