Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms