Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpusd2Q149F1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpusd2Q149F1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
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