Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC27■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rundc1Q0VDN7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Rundc1Q0VDN7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms