Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itgb8Q0VBD0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms