Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBB0

Prelid2, PRELI domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid2Q0VBB0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prelid2Q0VBB0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prelid2Q0VBB0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prelid2Q0VBB0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prelid2Q0VBB0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prelid2Q0VBB0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prelid2Q0VBB0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms