Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Vps8Q0P5W1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Vps8Q0P5W1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Vps8Q0P5W1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Vps8Q0P5W1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Vps8Q0P5W1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Vps8Q0P5W1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Vps8Q0P5W1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Vps8Q0P5W1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Vps8Q0P5W1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Vps8Q0P5W1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Vps8Q0P5W1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Vps8Q0P5W1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Vps8Q0P5W1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Vps8Q0P5W1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Vps8Q0P5W1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Vps8Q0P5W1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Vps8Q0P5W1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Vps8Q0P5W1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Vps8Q0P5W1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Vps8Q0P5W1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Vps8Q0P5W1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Vps8Q0P5W1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Vps8Q0P5W1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Vps8Q0P5W1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Vps8Q0P5W1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Vps8Q0P5W1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Vps8Q0P5W1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Vps8Q0P5W1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Vps8Q0P5W1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Vps8Q0P5W1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Vps8Q0P5W1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Vps8Q0P5W1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Vps8Q0P5W1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Vps8Q0P5W1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Vps8Q0P5W1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Vps8Q0P5W1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Vps8Q0P5W1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms