Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ttc21bQ0HA38 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Ttc21bQ0HA38 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ttc21bQ0HA38 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ttc21bQ0HA38 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ttc21bQ0HA38 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ttc21bQ0HA38 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ttc21bQ0HA38 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ttc21bQ0HA38 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ttc21bQ0HA38 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ttc21bQ0HA38 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ttc21bQ0HA38 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ttc21bQ0HA38 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ttc21bQ0HA38 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ttc21bQ0HA38 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ttc21bQ0HA38 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ttc21bQ0HA38 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ttc21bQ0HA38 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ttc21bQ0HA38 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ttc21bQ0HA38 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ttc21bQ0HA38 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ttc21bQ0HA38 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ttc21bQ0HA38 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ttc21bQ0HA38 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ttc21bQ0HA38 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ttc21bQ0HA38 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ttc21bQ0HA38 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ttc21bQ0HA38 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ttc21bQ0HA38 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ttc21bQ0HA38 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ttc21bQ0HA38 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ttc21bQ0HA38 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ttc21bQ0HA38 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ttc21bQ0HA38 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ttc21bQ0HA38 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ttc21bQ0HA38 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ttc21bQ0HA38 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ttc21bQ0HA38 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ttc21bQ0HA38 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ttc21bQ0HA38 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ttc21bQ0HA38 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ttc21bQ0HA38 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ttc21bQ0HA38 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ttc21bQ0HA38 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ttc21bQ0HA38 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ttc21bQ0HA38 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ttc21bQ0HA38 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ttc21bQ0HA38 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ttc21bQ0HA38 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ttc21bQ0HA38 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ttc21bQ0HA38 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ttc21bQ0HA38 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ttc21bQ0HA38 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms