Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q08AU9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q08AU9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q08AU9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q08AU9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q08AU9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q08AU9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q08AU9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q08AU9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q08AU9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q08AU9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q08AU9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q08AU9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q08AU9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q08AU9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q08AU9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q08AU9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q08AU9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q08AU9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q08AU9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q08AU9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q08AU9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q08AU9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q08AU9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q08AU9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q08AU9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q08AU9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q08AU9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q08AU9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q08AU9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q08AU9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q08AU9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q08AU9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q08AU9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q08AU9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q08AU9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q08AU9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q08AU9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q08AU9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q08AU9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q08AU9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q08AU9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q08AU9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q08AU9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q08AU9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q08AU9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q08AU9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q08AU9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q08AU9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q08AU9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q08AU9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q08AU9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q08AU9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q08AU9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q08AU9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q08AU9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q08AU9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q08AU9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q08AU9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Q08AU9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q08AU9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q08AU9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q08AU9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q08AU9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q08AU9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q08AU9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Q08AU9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q08AU9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q08AU9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q08AU9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q08AU9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q08AU9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q08AU9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q08AU9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q08AU9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Q08AU9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q08AU9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q08AU9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q08AU9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q08AU9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q08AU9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q08AU9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q08AU9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q08AU9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q08AU9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q08AU9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q08AU9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q08AU9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q08AU9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q08AU9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q08AU9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q08AU9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q08AU9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q08AU9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q08AU9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q08AU9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q08AU9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q08AU9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q08AU9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q08AU9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms