Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tgm3Q08189 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tgm3Q08189 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms