Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnn2Q08093 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnn2Q08093 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms