Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NrepQ07475 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NrepQ07475 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NrepQ07475 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NrepQ07475 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NrepQ07475 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NrepQ07475 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NrepQ07475 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NrepQ07475 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NrepQ07475 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms