Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Siah1bQ06985 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Siah1bQ06985 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Siah1bQ06985 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms