Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atf4Q06507 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms