Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Col9a1Q05722 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col9a1Q05722 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms