Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoc2Q05020 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoc2Q05020 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms