Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Sox13Q04891 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms