Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sox9Q04887 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox9Q04887 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox9Q04887 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms