Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Sox8Q04886 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox8Q04886 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms