Protein–RNA interactions for Protein: Q04863

Relb, Transcription factor RelB, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelbQ04863 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RelbQ04863 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelbQ04863 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RelbQ04863 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RelbQ04863 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RelbQ04863 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RelbQ04863 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RelbQ04863 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RelbQ04863 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RelbQ04863 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RelbQ04863 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RelbQ04863 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RelbQ04863 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RelbQ04863 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms