Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Smarcad1Q04692 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smarcad1Q04692 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms